للناظم الكثير من الكتب التي فقدت نسخها المخطوطة، وبقيت أسماؤها مذكورة في كتابه (الهبات الهنيات في المصنفات الجعبريات)، أو في كتب التراجم التي ترجمت للناظم.
وقد يظهر بعضها مستقبلًا -بإذن الله- عندما تتم فهرسة بقية مكتبات المخطوطات في العالم الإسلامي، ومن هذه الكتب المفقودة: