* كتابة نص المخطوط من النسخة المبيضة (أ)، وفقا لقواعد الإملاء الحديثة، مع وضع علامات الترقيم اللازمة لتوضيح النص، وإثبات رقم اللوحة مع بيان كونها يمين القارئ (أ) أو يساره (ب)، ووضع سطر تحت الكلمة الأولى في بداية اللوحة.
* مقابلة النسختين (أ)، (ب)، وإثبات ما في (أ) في النص الرئيسي، وإذا كان من فروق بينها وبين (ب)، أو زيادة أو سقط فقد أثبته في الهامش، مع بيان أيهما الأصح.
* وضع نص تفسير أبي السعود في أعلى الصفحة، مع كتابته بخط كبير ومائل، وفصلت بينه وبين نص حاشية الشيخ السقا بسطر أفقي، وصدرته بقول: تفسير الإمام أبي السعود.
* وضع نص الحاشية تحت هذا السطر الأفقي، وكتابته بخط أقل من سابقه وغير مائل، مصدرا بقول: حاشية الشيخ إبراهيم السقا.
* أما كلمات تفسير الإمام أبي السعود المشروحة في حاشية الشيخ السقا فجعلتها بخط كبير وثقيل ومائل فوق السطر، ومثله تحت السطر بالإضافة إلى وضعها بين قوسين.
* ولما كان صلب الحاشية قائم على تفسيري (الكشاف) و(أنوار التنزيل) وشروحهما، فقد كتبت العبارات التي يذكرها شراحهما من صلب هذين التفسيرين بخط ثقيل، ووضعته بين قوسين.